申请医疗器械二三类医疗器械经营许可证办理流程：

1、营业执照

2、法定代表人、企业负责人、质量负责人的学历或者职称证明

3、组织机构与部门设置说明

4、拟经营范围

5、经营场所、库房地址的地理位置图、平面图

6、房屋产权证明文件或者租赁协议复印件

7、计算机信息管理系统说明

8、质量协议（储运委托合同）

9、医疗器械第三方物流经营企业营业执照

10、医疗器械第三方物流经营企业《第二类医疗器械经营备案凭证》

11、拟委托贮存配送服务协议

12、经营设施、设备目录

13、经营质量管理制度、工作程序等文件目录

14、申报材料真实性自我保证声明